খানসামা উপজেলার সম্পূর্ণ পশ্চিম সীমানা জুড়ে ঐতিহ্যবাহী আত্রাই নদী প্রবাহিত হয়েছে।এ জনপদটির বিকাশ ঘটেছে আত্রাই নদীকে কেন্দ্র করে। এ ছাড়া এ উপজেলার অন্যান্য উল্লেখযোগ্য নদীগুলো হচ্ছে ইছামতি, বেলান নদী ও ভূল্লী নদী।উপজেলার স্বল্পসংখ্যক মৎস্যজীবি মানুষ তাদের জীবিকা নির্বাহ এ নদীগুলো থেকে মৎস্য শিকারের মাধ্যমে করে থাকে।এ ছাড়া কৃষি নির্ভর এ জনপদে সেচ কাজে নদী গুলো ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়ে থাকে।
পরিকল্পনা ও বাস্তবায়নে: মন্ত্রিপরিষদ বিভাগ, এটুআই, বিসিসি, ডিওআইসিটি ও বেসিস